ابزاری برای کنترل مقاومت آنتی بیوتیکی در حوضه های آبخیز پورتوریکو پس از طوفان ماریا – ScienceDaily


هنگامی که طوفان ماریا در سپتامبر 2017 زمین را ویران کرد ، ویران کننده دومنیکا ، سنت کرواکس و پورتوریکو ، سیل و قطع برق باعث ویرانی در زمین های تهی شده شد ، و باعث آلودگی مجاری آب با زباله های انسانی و عوامل بیماری زا تصفیه نشده شد.

شش ماه پس از طوفان مرگبار رده 5 ، امی پرودون ، استاد مهندسی عمران و محیط زیست ویرجینیا تك ، تیمی از محققان ویرجینیا تك را رهبری كرد ، از جمله ماریا ویرجینیا ریكلمه و ویلیام رودز ، همكاران پسا دكترا ، كه چمدان ها و مواد آزمایشگاهی را جمع می كردند. ریکو

کشور جزیره ای ایالات متحده ، واقع در شمال شرقی کارائیب ، ویران شده است و 3.4 میلیون نفر را در بحران غرق کرده است. تخریب گسترده یک فرصت مهم برای محققان است تا دریابند که چگونه آسیب به زیرساخت های فاضلاب می تواند به گسترش مقاومت آنتی بیوتیکی کمک کند – تهدیدی رو به رشد جهانی برای سلامت عمومی.

در مطالعه ای که در انجمن شیمی آمریکا منتشر شده است مجله علوم و فنون محیط زیست ، محققان ویرجینیا تک و همکاران بین المللی با استفاده از تکنیک های تعیین توالی DNA برای تشخیص شیوع بیماری در حوضه های آبخیز تحت تأثیر طوفان های بزرگ ، رویکرد ابتکاری بیشتری را برای نظارت بر مقاومت آنتی بیوتیکی ایجاد کردند.

پرودون ، دبلیو توماس رایس ، استاد مهندسی عمران و محیط زیست گفت: “این مطالعه یک گام حیاتی در جهت ایجاد یک رویکرد نظارت واحد و جامع بر مقاومت آنتی بیوتیکی در حوزه های آبخیز است.” “در حالت ایده آل ، می توان آن را به عنوان پایه ای برای ردیابی اختلالات و نگرانی های بهداشت عمومی مربوط به طوفان های آینده استفاده کرد.”

طی یک دهه گذشته ، پرودون ، میکروبیولوژیست و مهندس محیط زیست ، با دانشجویان خود با استفاده از توالی یابی DNA بعدی ، تخصص پروودن ، برای بررسی سویه های لژیونلا در حالی که کار قبل ، در طی ، پس از آن و خارج از شیوع لژیونرها در زمینه های مختلف بود ، کار کرده است. شهرهای سراسر کشور ، از جمله فلینت ، میشیگان.

RAPID توسط بودجه بنیاد ملی علوم و با همکاری محقق اصلی کریستینا بندوراگودا ، محقق دانشگاه واشنگتن با تجربه در زمینه مدل سازی حوزه های آبخیز و تجزیه و تحلیل مکانی ، محققان فناوری ویرجینیا با Graciela Ramirez Toro ، استاد و مدیر همکاری کردند آموزش و پرورش ، Conservación e Interpretación Ambiental و گروه تحقیقاتی وی در دانشگاه محلی Interamerican در سن هرمان ، پورتوریکو. آنها با هم ، سه سایت نمونه برداری را در حوضه های آبخیز با الگوهای مختلف استفاده از زمین و سطح فاضلاب ورودی شناسایی کردند ، که برای ردیابی الگوهای زمین مکانی در ظهور ژن های باکتریایی که باعث مقاومت آنتی بیوتیکی می شوند ، ایده آل بودند.

دانشجوی دکتری پرودون و اولین نویسنده مقاله ، بنجامین دیویس ، از روشی به نام توالی یابی متاژنومیک تفنگ برای شناسایی ژن های مقاومت به آنتی بیوتیک در نمونه های آب رودخانه از سه حوزه ، از جمله نمونه های جمع آوری شده توسط انتقال به حوزه های باکره دور کوهستانی استفاده کرد. و سه تصفیه خانه فاضلاب در پایین دست متاژنومیکس مطالعه مواد ژنتیکی است که مستقیماً از نمونه های محیطی بازیابی می شود.

تجزیه و تحلیل داده ها نشان داد که دو نشانگر انسانی مقاومت آنتی بیوتیکی – توالی DNA مرتبط با قرار گرفتن در معرض انسان در حوضه آبریز – با یک مجموعه جداگانه از ژن های مقاومت آنتی بیوتیکی در ارتباط است ، در مقایسه با نشانگرهای مدفوع انسانی.

یک تفاوت واضح بین تأثیر کارخانه تصفیه بر مشخصات ژنتیکی مقاومت آنتی بیوتیکی وجود داشت و سطح آن در پایین دست گیاه تصفیه افزایش یافت و منجر به ایجاد طیف گسترده ای از ژن ها در مقاومت آنتی بیوتیک های مهم از نظر بالینی مانند بتا لاکتام ها و آمینوگلیکوزیدها در آب شد. نمونه ها. برخی از ژنهای مقاومت بتا لاکتام یافت شده با عفونتهای کشنده مقاوم در برابر آنتی بیوتیک در منطقه مرتبط بوده و شواهدی از توانایی دور زدن سویه های باکتریایی را نشان می دهد. گزارش شده است که ژن های مقاومت بتا لاکتام نیز نشانگرهای انسانی با دقت بیشتری نسبت به نشانگرهای مدفوع را در انسان پیش بینی می کنند.

محققان گفتند ، اگرچه سطح پایه ژن های مقاومت آنتی بیوتیکی در حوضه های آبخیز پورتوریکو قبل از طوفان ماریا ناشناخته است ، اما از روش های نظارتی نظیر این موارد می توان برای ارزیابی اثرات طوفان های بزرگ در آینده در گسترش مقاومت آنتی بیوتیکی استفاده کرد.

بعید است که بسیاری از جوامع بین المللی در آینده نزدیک به ابزارهای پیشرفته مانیتورینگ مبتنی بر متاژنومی دسترسی داشته باشند ، اما شناسایی اهداف تک ژنی ، مانند مارکرهای مقاومت آنتی بیوتیکی انسانی ، نظارت بر حوزه مقاومت آنتی بیوتیکی را بسیار بیشتر در دسترس قرار می دهد. و چنین ژن هایی را می توان مستقیماً با یک واکنش زنجیره ای پلیمراز کمی کمی کرد و در کمتر از یک روز نتایج سریع و مقرون به صرفه ای ایجاد کرد.


منبع: packge-news.ir

Leave a reply

You may use these HTML tags and attributes: <a href="" title=""> <abbr title=""> <acronym title=""> <b> <blockquote cite=""> <cite> <code> <del datetime=""> <em> <i> <q cite=""> <s> <strike> <strong>